Kenmerken genotype, reactiestandaard, bepaling

Hij genotype Het wordt gedefinieerd als de set genen (met hun allelen) die ze coderen voor een bepaald kenmerk of kenmerk, die van anderen worden onderscheiden door een specifieke functie of volgorde. Sommige auteurs definiëren het echter ook als het deel van het genoom dat aanleiding geeft tot het fenotype of als de allelische constitutie van een organisme.

Hoewel gerelateerd, zijn de termen genotype en fenotype niet hetzelfde. In deze zin wordt fenotype gedefinieerd als de set van zichtbare kenmerken van een organisme die het resultaat zijn van de expressie van de genen, en voor het genotype als de set van genen die resulteren in een bepaald fenotype.

Genotype en fenotype (Bron: National Human Genome Research Institute [Public Domain] via Wikimedia Commons) Het genotype is slechts een van de factoren die betrokken zijn bij de oprichting van het fenotype, omdat de invloed van de omgeving en andere epigenetische elementen die niet direct gerelateerd zijn die niet direct gerelateerd zijn naar de nucleotidesequentie vormt ook de zichtbare kenmerken van individuen.

Twee organismen hebben dus hetzelfde genotype als ze dezelfde gensets delen, maar hetzelfde geldt niet voor twee organismen die blijkbaar hetzelfde fenotype delen, omdat vergelijkbare kenmerken het product van verschillende genen kunnen zijn.

Het was de Deense botanicus Wilhelm Johansen, in 1909, die voor het eerst de termen genotype en fenotype in een leerboek introduceerde, in een leerboek dat hij getiteld "De elementen van een theorie over de exacte erfenis ", Dat was het product van een reeks experimenten die pure lijnen van gerst en erwten uit elkaar gingen.

Zijn werken, waarschijnlijk geïnspireerd door die enkele jaren eerder gemaakt door Gregorio Mendel, beschouwd als "Genetica vader”, Stond hem toe te verduidelijken dat het genotype van een organisme het fenotype geeft door verschillende ontwikkelingsprocessen en onder invloed van de omgeving.

[TOC]

Kenmerken

Genotype is niet precies hetzelfde als genoom. Hier is het onderscheid tussen beide concepten:

- "Genoom" verwijst naar alle genen die een individu heeft geërfd van zijn ouders en hoe hij wordt verdeeld in de chromosomen in de kern.

- "Genotype" is de term die wordt gebruikt om bijvoorbeeld te verwijzen naar de set genen en hun varianten die aanleiding geven tot een bepaald kenmerk, dat een individu wordt onderscheiden binnen een populatie of een soort.

Hoewel het vatbaar is voor veranderingen als gevolg van mutaties in de vitale geschiedenis van een organisme, is het genotype een relatief onveranderlijk kenmerk van individuen, omdat in theorie de genen die worden geërfd, hetzelfde zijn van conceptie tot dood.

In een natuurlijke populatie hebben de allelen die een bepaald genotype vormen verschillende uiterlijkfrequenties; Dat wil zeggen, sommigen verschijnen meer in populaties dan andere en dit heeft betrekking op sommige dingen, met distributie, omgevingscondities, de aanwezigheid van andere soorten, enz.

De term "genotype wild"Definieert de eerste allel variant die in de natuur wordt gevonden, maar verwijst niet noodzakelijkerwijs naar het allel dat vaker binnen een populatie wordt gevonden; en de term "genotype Mutant"Het wordt momenteel gebruikt om die allelen te definiëren dan het wild.

Om een ​​genotype te schrijven, worden hoofdletters en kleine letters meestal gebruikt, om onderscheid te maken tussen de allelen die een persoon bezit, of het nu homozygotisch of heterozygoot is. Hoofdletters worden gebruikt om dominante en kleine letters voor recessieven te definiëren.

Genotype -reactieregel

Individuen erven de genen van hun ouders, maar niet de eindproducten die worden verkregen uit hun uitdrukking, omdat ze afhankelijk zijn van veel externe factoren en de geschiedenis van hun ontwikkeling.

Volgens dit en alleen verwijzend naar omgevingsfactoren, kan een genotype leiden tot meer dan één fenotype. De set van mogelijke "resultaten" van de interactie van een specifiek genotype met verschillende omgevingen is wat wetenschappers "genotype -reactieregel" hebben genoemd ".

De reactienorm van een genotype is dan een soort "kwantificering" of registratie van de zichtbare kenmerken verkregen uit de interacties van een genotype met bepaalde omgevingen. Het kan worden uitgedrukt als afbeeldingen of tabellen die de mogelijke resultaten "voorspellen".

Het is natuurlijk duidelijk dat de reactiestandaard alleen verwijst naar een gedeeltelijk genotype, een gedeeltelijk fenotype en enkele omgevingsfactoren, omdat het in de praktijk erg moeilijk is om absoluut alle interacties en alle resultaten hiervan te voorspellen.

Hoe wordt genotype bepaald?

Bepaal het genotype of "genotipify" een organisme of een populatie individuen van dezelfde soort, biedt veel waardevolle informatie over de evolutionaire biologie, de bevolkingsbiologie, de taxonomie, zijn ecologie en zijn genetische diversiteit.

In micro -organismen zoals bacteriën en gisten, omdat ze hogere vermenigvuldigings- en mutatiesnelheden hebben dan de meeste multicellulaire organismen, maakt het bepalen en kennen van het genotype het mogelijk om de identiteit van de kolonies in de collecties te beheersen, evenals het vaststellen van enkele kenmerken van epidemiologie, ecologie en taxonie van hetzelfde.

Om het genotype te bepalen, is het noodzakelijk om monsters te verkrijgen van het organisme waarmee u wilt werken, en de benodigde soorten monsters zijn afhankelijk van elk organisme. Bij dieren kunnen bijvoorbeeld monsters van verschillende weefsels worden genomen: staart, oren, uitwerpselen, haar of bloed.

Het genotype van een organisme kan experimenteel worden bepaald dankzij het gebruik van enkele moderne technieken, die afhankelijk zullen zijn van de genomische locatie van de genen om te bestuderen, het budget en de tijd, het gebruiksgemak en de mate van prestaties die gewenst zijn.

Momenteel omvatten de technieken die worden gebruikt voor de genotipificatie van een organisme, heel vaak het gebruik en analyse van moleculaire markers om polymorfismen in DNA te detecteren en andere meer geavanceerde technieken die genoomsequencing impliceren.

Meer werknemersmarkeringen

Onder de meest gebruikte markeringen vinden we het volgende:

- RFLPS (polymorfismen van restrictiefragmenten).

- AFLP's (geamplificeerde fragmenten lengte polymorfismen).

- RAPD's (willekeurig geamplificeerd polymorf DNA).

- Microsatellieten of SSR's (herhaalde eenvoudige volgorde).

- Asaps (primers geassocieerd met specifieke allelen).

- SNP's (eenvoudige nucleotide polymorfismen).

Technieken die sequencing en hybridisatie gebruiken

En onder de technieken die specifieke sequencing en hybridisatie van specifieke sondes gebruiken, zijn:

- Sequencing volgens de methode van Sanger.

- High Performance genotipificatie.

- Repetitie "Gouden Poort”Van Illumina.

- Sequencing Genotipification (GBS).

- Taqman essay.

- Nieuwe generatie sequencing.

- Microarrers.

- Volledige genoomsequencing.

Referenties

1. Griffiths, een., Wessler, s., Lewontin, r., Gelbart, W., Suzuki, D., & Miller, J. (2005). Een inleiding tot genetische analyse (8e ed.)). Freeman, W. H. & Bedrijf.
2. Klug, W., Cummings, m., & Spencer, c. (2006). Concepten van genetica (8e ed.)). New Jersey: Pearson Education.
3. Kwok, P.-EN. (2001). Methoden voor genotypering van enkele nucleotide polymorfismen. Annu. Revisie. Genomics Hom. Genet., 2(11), 235-258.
4. Mahner, m., & Kary, m. (1997). Wat zijn precies genomen, genotypen en fenotypes? En hoe zit het met fenomenen ? J. Theorie. Biol., 186, 55-63.
5. Mueller, u. G., & Wolfenbarger, l. L. (1999). AFLP -genotypering en vingerafdrukken. Boom, 14(10), 389-394.
6. National Institute of Health. Ontvangen op 14 mei 2019, van www.NIH.Gov/
7. Patel, D. NAAR., Zander, m., Dalton-Morgan, J., & Batley, J. (2015). Vooruitgang in plantengenotypering: waar de toekomst ons zal brengen. In j. Batley (Ed.)), Plantengenotypering: methoden en protocollen (Vol. 1245, pp. 1-11). New York: Springer Science + Business Media, New York.
8. Pierce, B. (2012). Genetica: een conceptuele benadering. Freeman, W. H. & Bedrijf.
9. Schleif, r. (1993). Biologie -genetica en moleculair (2e ed.)). Maryland: de Johns Hopkins University Press.
10. Tümmler, B. (2014). Genotyperingsmethoden. In een. Filloux & J. L. Ramos (eds.)), Methoden in moleculaire biologie (Vol. 1149, pp. 33-47). New York.
11. Yang, W., Kang, x., Yang, Q., Lin, en., & Fang, m. (2013). Beoordeling over de ontwikkeling van genotyperingsmethoden voor het beoordelen van diversiteit van boerderijdieren. Journal of Animal Science and Biotechnology, 4(2), 2-6.